监理工程师的三个专业分别是 土木建筑工程、 交通运输工程和 水利工程。在选择专业时，可以考虑以下几个方面：

市场需求

土木建筑工程：这是监理工程师中最为广泛和基础的一个方向，主要涉及建筑工程、房屋建设、市政工程等领域。市场需求大，就业机会丰富，职业发展空间大。

交通运输工程：主要涉及公路、铁路、桥梁、隧道等交通基础设施的建设和维护。国家政策支持，项目资金充足，发展前景广阔。专业科目分为公路工程和水运工程两个方向。

水利工程：涉及水利工程施工监理、水土保持工程施工监理、机电及金属结构设备制造监理、水利工程建设环境保护监理等。专业相对小众，竞争压力较小，但未来也有很好的发展前景。

个人兴趣和职业规划

如果对建筑工程、房屋建设、市政工程等领域感兴趣，并且未来希望在这些领域发展，那么选择土木建筑工程专业是合适的。

如果对交通基础设施的建设和维护感兴趣，希望参与到国家重大基础设施建设项目中，那么选择交通运输工程专业是理想的选择。

如果对水资源管理和利用感兴趣，希望在水务行业有所发展，那么选择水利工程专业是一个不错的选择。

考试难度

监理工程师三个专业从易到难排行是：土木建筑工程 < 交通运输工程 < 水利工程。土木建筑工程专业相对简单，报考人数最多，市场需求热门。

注册和专业方向

在申请注册时，应根据自己的从业领域和经验，选择确认注册公路工程或水运工程专业类别。选择注册公路工程专业的，可以从道路与桥梁、隧道工程、公路机电工程三个注册专业中选择注册2个专业；选择注册水运工程专业的，可以从港口工程、航道工程、水运机电工程三个注册专业中选择注册2个专业。

综上所述，选择监理工程师的专业时，应综合考虑市场需求、个人兴趣和职业规划、考试难度以及注册和专业方向等因素。如果还没有确定未来工作方向，可以先选择报考人数最多、市场需求热门的土木建筑工程专业，再根据个人情况增项交通或水利专业。