菏泽学院的工科专业排名如下：

机械电子工程

省级：

该专业在2024年省级专业排名中位列第一。

推荐指数：4.4（121人推荐）。

全国排名：在2023年校友会排名中位列中国一流应用型专业A+（第5名）。

化学工程与工艺

省级：

该专业在2024年省级专业排名中位列第三。

全国排名：在2023年校友会排名中位列中国高水平应用型专业B++（第23名）。

电气工程及其自动化

专业培养目标：

本专业培养能够从事与电气工程有关的系统运行、自动控制、电力电子技术、信息处理、试验分析、研制开发、经济管理以及电子与计算机技术应用等领域工作的宽口径"复合型"高级工程技术人才。

自动化

省级：

该专业在2024年省级专业排名中位列第七。

全国排名：在2023年校友会排名中位列中国一流应用型专业A+（第2名）。

生物工程

省级：

该专业在2024年省级专业排名中位列第五。

全国排名：在2023年校友会排名中位列中国高水平应用型专业B++（第27名）。

这些排名综合了不同来源的数据，包括省级排名、全国排名以及专业培养目标等信息。建议学生在选择专业时，可以综合考虑这些排名信息，以找到最适合自己的发展方向。