在深圳选择三甲医院的专业科室，可以参考以下建议：

明确需求：

首先明确自己的需求，例如是看眼科、儿科、骨科还是其他科室。不同的医院在这些科室的专长和优势可能会有所不同。

医院排名和声誉：

参考医院的综合排名和声誉，选择那些在相应科室有较高知名度和经验的医院。例如，深圳市人民医院、北京大学深圳医院、香港大学深圳医院等医院在多个科室都有很强的实力。

医生资质：

查看医生的专业资质和临床经验。选择那些具有丰富临床经验和专业认证的医生，确保他们具备足够的专业能力。

设备和技术：

了解医院的设备和技术水平。先进的设备和技术能够提供更准确的诊断和治疗。

患者评价：

参考其他患者的评价和反馈，了解医院的服务质量和治疗效果。

医院特色：

有些医院在某些特定领域有独特的优势，例如深圳平乐骨伤科医院在骨科方面有很好的口碑，深圳市中医院在中医治疗方面有显著成就。

地理位置：

选择离自己居住地较近的医院，方便就诊和后续的复查。

综合以上信息，可以根据自己的具体需求，选择那些在相应科室具有专业优势、设备先进、医生资质高、患者评价好的三甲医院。例如，如果需要看眼科，可以考虑深圳市人民医院或香港大学深圳医院；如果需要看儿科，深圳市儿童医院是一个很好的选择。