中国协和医科大学（现更名为北京协和医学院，清华大学医学部）拥有 7所临床医院。这些医院包括：

1. 北京协和医院

2. 阜外心血管病医院

3. 中国医学科学院肿瘤医院

4. 中国医学科学院整形外科医院

5. 天津血液病医院

6. 南京皮肤病医院

7. 北京天坛医院（与北京市共建）

此外，学校还拥有其他教学医院，如中国航天科技集团公司总医院和煤炭工业部总医院等。