新疆农业大学的硕士专业排名如下：

种子科学与工程- 全国排名第4位

农业资源与环境- 全国排名第5位

设施农业科学与工程- 表现出色

草业科学- 表现出色，全国排名中名列第1

农林经济管理- 表现出色

农业水利工程- 表现出色

园艺- 表现出色

水利水电工程- 表现出色

土地资源管理- 表现出色

农学- 表现出色

马业科学- 全国排名第1位

动物科学- 受学生和社会认可

动物医学-

这些排名显示了新疆农业大学在多个学科领域的强劲实力和较高的全国认可度。特别是草业科学、种子科学与工程和农业资源与环境等专业在全国范围内都取得了很好的名次。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些排名靠前的专业，以便获得更好的学术发展和职业前景。