菲律宾音乐专业排名前三的大学如下：

马尼拉圣保罗大学（Saint Paul University Manila）

成立于1912年，位于菲律宾首都马尼拉，提供本科、硕士、博士学位，专业包括音乐学、教师教育、护理学、管理学等。音乐专业在菲律宾排名前三，拥有雄厚的师资力量和丰富的教学经验。

菲律宾女子大学（The Philippine Women's University）

成立于1919年，是一所男女同校的综合性大学。提供音乐哲学博士（音乐演奏方向）课程。其音乐学院是菲律宾首屈一指的专业音乐教育机构，以高质量的教育和音乐文凭闻名。

菲律宾大学（University of the Philippines, UP）

成立于1908年，是菲律宾排名第一的院校，也是唯一的公立大学。拥有悠久的教育历史和完善的教学体系。

建议：

马尼拉圣保罗大学：

如果你对音乐学有深入研究的需求，并且希望在菲律宾获得高质量的音乐教育，马尼拉圣保罗大学是一个非常好的选择。该校不仅提供从本科到博士的完整教育体系，而且师资力量雄厚，教师均为音乐领域的专家。

菲律宾女子大学：如果你希望专注于音乐演奏方向，并且希望获得音乐哲学博士学位，菲律宾女子大学是一个理想的选择。该校的音乐学院在菲律宾享有极高的声誉，以高质量的教育和音乐文凭闻名。

菲律宾大学：作为菲律宾排名第一的公立大学，菲律宾大学拥有悠久的教育历史和完善的教学体系，是一个综合性的学术机构，适合希望获得全面教育的学生。