国内音乐指挥专业的排名如下：

中央音乐学院

上海音乐学院

中国音乐学院

天津音乐学院

北京舞蹈学院

南京艺术学院

福建师范大学

首都师范大学

哈尔滨音乐学院

武汉音乐学院

山东师范大学

北京师范大学

湖南师范大学

上海师范大学

东北师范大学

这些学院在音乐教育领域享有盛誉，并且拥有优秀的指挥专业。中央音乐学院和上海音乐学院在指挥专业方面非常强大，尤其在西洋乐和民族乐方面具有显著优势。中国音乐学院以国学为根基，在音乐理论研究、创作、表演和教育方面具有特色。天津音乐学院、北京舞蹈学院、南京艺术学院、福建师范大学、首都师范大学、哈尔滨音乐学院、武汉音乐学院、山东师范大学、北京师范大学、湖南师范大学、上海师范大学和东北师范大学等学院也在音乐指挥专业方面具有较高的声誉。