南京高校的专业排名如下：

南京大学

综合类大学全国排名第6名，有90个专业上榜，其中39个为A+专业。

王牌专业包括地质学、天文学、人工智能、环境科学、大气科学、化学、英语、哲学、历史学、软件工程、物理学、新闻学、汉语言文学、地理信息科学、图书馆学、电子信息科学与技术、自然地理与资源环境、社会工作、社会学、信息管理与信息系统、会计学、考古学、声学、水文与水资源工程、金融工程、应用气象学、工业工程等。

东南大学

综合类大学全国排名第21名，有88个专业上榜，其中22个为A+专业。

王牌专业包括通信工程、水资源工程等。

南京理工大学

理工类大学全国排名第18位，江苏省高校排名第6位。

最好的专业包括武器系统与工程、化学工程与工艺、自动化、机械工程、电子信息工程、材料科学与工程等。

南京农业大学

全国排名第44位，以农业和生命科学为优势和特色。

王牌专业包括法学、马克思主义理论、社会学、兽医学等。

南京航空航天大学

全国排名第49位，是一所实力很强的211高校。

南京师范大学

在多个学科领域有较强实力，但具体排名未详细列出。

河海大学

全国排名第50位，以水资源工程方面领先。

南京艺术学院

全国排名第4位，有40个专业上榜，其中3个专业位列全国第一。

南京邮电大学

全国排名第57位，广播电视工程专业位列全国第一位。

南京审计大学

全国唯一以“审计”命名的高校，工程审计专业位居全国第一位。

这些排名信息来源于不同时间点的发布，具体排名可能会有变动。建议参考最新的官方发布或权威排名机构的信息以获取最准确的排名数据。