特种作战学院主要开设以下专业：

作战指挥：

本专业主要学习党的创新理论、军事基础理论和技能、自然科学基础理论、人文社会科学基础和管理科学基础知识。掌握空投空降、攀登横越、实战格斗、特种装备、特种侦察、无人作战、水下作战、特种射击、特种爆破、狙击作战等特战技能课程。参加部队实习和战役战术综合演习，完成初级指挥军官的基本训练。使学员系统地掌握特种作战初级指挥军官岗位必备的专业理论和技能，具有较强的科学、人文、军事素养，具备指挥作战、组织训练、管理教育和做基层政治工作的岗位任职能力。

侦察情报：

本专业主要学习党的创新理论、军事基础理论和技能、自然科学基础理论、人文社会科学基础和管理科学基础知识。学习侦察与情报处理、侦察兵战术、侦察分队战术、侦察兵极限训练等专业课程。掌握仪器侦察、武装侦察、特种侦察、无人侦察等侦察技能。使学员掌握情报搜集传输、情报分析整编、战场态势融合的基本方法和技能，具有战略视野、战术思维和情报意识，具备从事侦察情报对抗和研发、装备原理及使用、战法研究、作战指挥和管理部队的任职能力。

指挥信息系统工程：

本专业主要学习军事信息基础、思想政治基础、自然科学基础、人文社会科学、指挥控制的基础理论以及指挥信息系统分析、设计等技术，完成信息化条件下特种部队联合作战初级指挥军官的基本训练。使学员掌握信息化作战、指挥控制、系统工程、运筹优化等方面的知识，具有计算机应用、网络通信应用、情报侦察应用、电子对抗应用、信息安全应用以及指挥信息系统综合运用开发能力，具备信息化作战策划、组织、实施和战场信息综合管理能力。

此外，学院还涉及以下专业领域：

特种作战

情报侦察

狙击作战

军事体育

这些专业均紧贴战场需求，适应未来战争形态，体现了一体融合的课程体系。