根据最新的排名信息，新疆体育专业院校的综合排名如下：

新疆体育职业技术学院

排名第1，是新疆地区体育专业学生的优选院校，尤其在休闲体育专业方面表现突出。

新疆师范大学

排名第2，其体育教育专业在全国体育学院中排名第45位，运动训练专业在新疆地区排名靠前。

石河子大学

排名第3，运动训练专业在新疆地区具有较高的教学水平和研究实力。

伊犁师范大学

排名第4，体育教育专业在新疆地区具有较高地位。

昌吉学院

排名第5，体育教育专业在新疆地区表现良好。

喀什大学

排名第6，体育教育专业在新疆地区具有较好的教学水平。

新疆农业大学体育部

排名第7，体育教育专业在新疆地区具有一定的教学实力。

新疆医科大学体育学院

排名第8，体育教育专业在新疆地区具有较好的教学水平。

新疆财经大学体育学院

排名第9，体育教育专业在新疆地区具有一定的教学实力。

新疆教育学院体育系

排名第10，体育教育专业在新疆地区具有一定的教学实力。

塔里木大学体育学院

排名第11，体育教育专业在新疆地区具有一定的教学实力。

广西国际商务职业技术学院

排名第12，体育教育专业在新疆地区表现一般。

许昌电气职业学院

排名第13，体育教育专业在新疆地区表现一般。

这些排名信息基于不同评价机构和标准，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化。建议以最新官方发布的信息为准。