以下是根据最新排名，全国植物保护专业最好的大学：

南京农业大学

浙江大学

中国农业大学

华中农业大学

西北农林科技大学

华南农业大学

福建农林大学

西南大学

贵州大学

山东农业大学

这些大学在植物保护领域具有很高的教学和研究水平，为学生提供了良好的学习环境和实践机会。建议根据个人兴趣和职业规划，选择适合的学校进行报考。