夏邑孔祖中等专业学校的专业设置包括 综合类（含体、音、美）、园林园艺、生物工程、机电一体化、旅游管理、计算机应用技术、财经、市场营销、车辆工程、建筑工程、播音主持、航空服务、幼儿保育、大数据技术应用、智能制造、网络应用与维护、中餐烹饪、汽车运用与维修、影像与影视技术（高级摄影师、高级化妆师）、平面设计、电子商务、UI界面设计、电商运营、旅游酒店服务与管理、形象视觉创意设计（飞图特色班）、服装制作与生产管理等二十八个专业。