水污染治理专业的高校排名如下：

清华大学

哈尔滨工业大学

北京大学

北京师范大学

浙江大学

北京工业大学

南开大学

同济大学

东南大学

河海大学

兰州交通大学

武汉大学

山东建筑大学

广州大学

重庆水利电力职业技术学院

杨凌职业技术学院

资阳环境科技职业学院

安徽水利水电职业技术学院

广东环境保护工程职业学院

广东水利电力职业技术学院

黑龙江建筑职业技术学院

黄河水利职业技术学院

建议在选择学校时，可以综合考虑学校的学科实力、师资力量、实验设施以及就业前景等多方面因素。