根据2024年QS世界大学排名，日本哲学专业排名如下：

东京大学- 排名第51位

京都大学- 排名第51位

大阪大学- 排名第151位

这些排名信息表明，在哲学专业方面，东京大学和京都大学是日本最强的两所大学，它们在全球的排名中都位于前列。大阪大学虽然排名稍低，但也在前200名之内，也是一个值得考虑的选项。

建议优先考虑东京大学和京都大学，因为它们在哲学领域的排名较高，均位于前50名，是日本哲学专业研究的强校。