山东理工大学的王牌专业排名如下：

新能源汽车工程（全国第4名）

农业智能装备工程（全国第6名）

农业机械化及其自动化（全国第11名）

电气工程及其自动化

自动化

交通运输

能源与动力工程

计算机科学与技术

法学

软件工程

生物科学（师范类）

智能电网信息工程

英语（师范类）

机械设计制造及其自动化（国家级特色专业）

车辆工程（国家级特色专业）

测控技术与仪器

化学工程与工艺

应用化学

测绘工程

矿物加工工程

信息与计算科学

国际经济与贸易

材料成型及控制工程

食品科学与工程

土木工程

建议优先选择新能源汽车工程、农业智能装备工程和农业机械化及其自动化这三个专业，因为它们在全国的排名较高，更受认可，同时也有利于未来的职业发展和学术深造。