南京比杭州多的大学数量为 12所。

南京共拥有13所985、211、双一流院校，包括南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京农业大学、南京师范大学、河海大学、中国药科大学、南京医科大学、南京邮电大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京中医药大学。而杭州只有一所浙江大学。

因此，南京在高等教育资源方面明显优于杭州。