李婧怡选择了北京大学的物理学类专业。在高考中，她取得了716分的高分，并且是浙江省的第一名。李婧怡之前就读于桐乡高级中学，并且是一名复读生。她因为对之前的专业不满意而从清华大学退学，选择回到学校重新复读。最终，李婧怡被北京大学录取，但具体录取的专业并未详细说明。根据她的选科组合“物生地”，以及她在物理、生物和地理三科中均取得了满分，可以推测她可能选择了与这些学科相关的专业。