南通理工学院的理科专业排名如下：

计算机科学与技术（嵌入式培养，前两年在海安校区就读，后两年在南通校区就读）。

新能源科学与工程（南通校区）。

机械设计制造及其自动化（南通校区）。

护理学（南通校区）。

物流管理（省级一流本科专业）。

汽车服务工程（省级一流本科专业）。

土木工程（省级一流本科专业）。

建议：

计算机科学与技术和 新能源科学与工程是南通理工学院较为热门且排名靠前的理科专业，尤其是计算机科学与技术（嵌入式培养）专业，前两年在海安校区就读，后两年在南通校区就读，这种培养模式可能更适合部分学生的需求。

机械设计制造及其自动化和 汽车服务工程也是学校的王牌专业，属于省级一流本科专业，具有较好的教学资源和实践机会。

物流管理和 土木工程同样属于省级一流本科专业，适合对物流管理和土木工程领域感兴趣的学生报考。

这些排名信息来源于不同时间点的数据，具有一定的参考价值。建议结合最新的招生信息和专业介绍，综合考虑自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。