水声工程专业主要学习以下课程：

自然辩证法概论和 科学社会主义理论与实践

基础英语和 专业英语

矩阵理论和 数理统计

声学原理与噪声控制

水声学基础

振动理论及其在工程中的应用

信号处理

数学物理方程

振动和声学问题计算

水下噪声学

近代试验技术

线性系统理论

最优估计理论与系统辨别

离散随机信号处理

机械工程和 交通运输工程

电路原理、 信号与系统和 模拟电子技术

这些课程涵盖了水声工程的基本理论和应用技能，旨在培养学生在声学、电子学、计算机科学等多学科交叉领域的知识和实践能力。