合肥职高兽医专业的课程设置主要包括以下几个方面：

专业基础课程

动物解剖与组织胚胎学

动物生理学

动物生物化学

兽医病理学

兽医药理学

兽医微生物学与免疫学

兽医内科学

兽医外科学

专业核心课程

畜禽解剖生理

兽医基础

动物营养与饲料

畜禽遗传繁育

畜禽环境卫生

养猪与猪病防治

养禽与禽病防治

养牛与牛病防治

畜禽疾病预防技术

畜禽传染病防治

畜禽寄生虫病防治

兽医诊疗技术

兽医临床诊断学

兽医影像学

动物检疫学

选修课程 （根据学校特色和兴趣选择）：

中兽医

传染病学

寄生虫学

诊断学

产科

手术学

特种经济动物学

兽医产科学

水产养殖技术

畜产品加工

食品营养与卫生

粮油加工技术

焙烤食品加工技术

果蔬加工技术

实践性教学环节

教学实习

生产实习

课程设计

毕业论文（毕业设计）

科研训练

生产劳动

社会实践

这些课程旨在培养学生掌握动物医学的核心知识，了解养殖行业的发展动态和市场需求，成为既懂医术又懂经营的复合型人才。通过这些课程的学习，毕业生可以从事宠物医院、动物保护组织、动物化验室、动物疫病防治机构等方面的工作。