以下是民办本科工科专业的排名情况：

机械设计制造及其自动化：

浙江树人大学，全国排名第1位。

电气工程及其自动化：

武汉工商学院，全国排名第2位。

食品科学与工程：

武汉轻工大学，全国排名第3位。

软件工程：

大连东软信息学院，6星级专业。

网络工程：

重庆移通学院，全国排名前二；珠海科技学院，全国排名前二；三江学院，全国排名前五；成都锦城学院，全国排名前五；山东协和学院，全国排名前五。

通信工程：

武昌首义学院，工程管理、通信工程等专业在业内认可度较高。

计算机科学与技术：

浙江树人大学、武汉华夏理工学院、上海建桥学院、齐鲁理工学院、南昌理工学院等高校在计算机科学与技术专业方面表现突出。

自动化：

武昌首义学院、文华学院、郑州工商学院等高校在自动化专业方面表现较好。

土木工程：

武昌首义学院、文华学院、郑州工商学院等高校在土木工程专业方面表现较好。

光电信息科学与工程：

武昌首义学院在光电信息科学与工程专业方面表现较好。

请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化。建议您在选择学校和专业时，综合考虑学校的办学层次、专业特色、师资力量以及个人兴趣和职业规划。