北京最好的大学是 清华大学和 北京大学。这两所大学在中国的高等教育体系中占据着举足轻重的地位，它们在国内外的排名中均名列前茅，是中国最顶尖的学术中心。

清华大学

排名：在多个排名中位列北京第一，全国排名中也常常位居榜首。

特点：清华大学是中国著名的高等学府，以理工科和工程技术见长，同时也在人文社科领域有显著成就。学校的前身是清华学堂，始建于1911年，曾是由美国退还的部分庚子赔款建立的留美预备学校。

北京大学

排名：通常位于全国排名的第二名，与清华大学齐名。

特点：北京大学是中国近代第一所国立综合性大学，以文理基础教学和研究为主，是国家培养高素质、创造性人才的摇篮。学校位于北京市海淀区颐和园路，创办于1898年。

这两所大学不仅在学术研究、教学质量、师资力量等方面处于国内领先地位，还在国际交流、科研成果转化等方面发挥着重要作用。因此，无论是从学术水平还是综合实力来看，清华大学和北京大学都是北京最好的大学。