云南农业学院的专业排名如下：

农业工程：

荣获中国三星级学科（3★）、区域一流学科，位居云南高校第2名，位列全国第24名，居全国前60%。

环境科学与工程：

荣获中国三星级学科（3★）、区域一流学科，位居云南高校第4名，位列全国第134名，居全国前60%。

马克思主义理论：

荣获中国三星级学科（3★）、区域一流学科，位居云南高校第7名，位列全国第357名，居全国前90%。

植物保护：

在2021年排名中位列前20%，在2022年根据四川省理科最低录取分数线排名中位列第一名。

畜牧学：

在2021年排名中位列前40%。

烟草：

在2022年根据四川省理科最低录取分数线排名中位列第三名。

水利水电工程：

在2022年根据四川省理科最低录取分数线排名中位列第四名。

动物科学：

在2022年根据四川省理科最低录取分数线排名中位列第五名。

食品科学与工程：

在2022年根据四川省理科最低录取分数线排名中位列第六名。

生物技术：

国家级特色专业，位列全国前90%。

建议：

农业工程、 环境科学与工程和 马克思主义理论在全国的排名较高，适合对相关专业有浓厚兴趣的学生报考。

植物保护、 畜牧学、 烟草、 水利水电工程、 动物科学和 食品科学与工程等专业在四川省的录取分数线较高，显示出其在考生中的受欢迎程度，也适合报考。

生物技术作为国家级特色专业，具有较高的学术水平和行业认可度，是学生的优选之一。

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了专业在全国和云南省的排名情况，具有较高的参考价值。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，同时参考这些排名信息。