地质工程专业博士排名如下：

中国地质大学（学科整体水平得分：92）

中国石油大学（华东）（学科整体水平得分：87）

成都理工大学（学科整体水平得分：86）

吉林大学（学科整体水平得分：84）

长安大学（5+）

中国矿业大学（5）

同济大学（5）

南京大学（5-）

中国地质大学（武汉）（未提及具体等级）

西南交通大学（未提及具体等级）

西安科技大学（未提及具体等级）

中国地质大学（北京）（未提及具体等级）

建议：

中国地质大学和 中国石油大学（华东）在地质工程学科整体水平上得分较高，建议优先考虑。

长安大学、 中国矿业大学和 同济大学等学校也在地质工程领域有较强实力，具体选择可根据个人研究方向和兴趣进行考虑。

成都理工大学和 吉林大学等学校也具备较好的教学和科研条件，可以作为备选。