药物研发最好的专业排名如下：

北京大学

中国药科大学

北京协和医学院

浙江大学

复旦大学

上海交通大学

山东大学

中山大学

四川大学

沈阳药科大学

这些排名基于不同的评价标准和时间点，但总体来看，上述大学在药学领域具有较高的声誉和研究实力，特别是在药物研发方面。