南京农业大学的植物保护专业在全国享有很高的声誉，并且根据最新的排名信息，该专业在全国植物保护一流学科中位居 前10%。此外，根据2024年校友会中国大学专业排名数据，南京农业大学的植物保护专业全国排名 第2，星级排名为 6，专业档次为 A+，办学层次为 世界高水平、中国顶尖专业。

综合以上信息，南京农业大学的植物保护专业在全国排名中表现非常出色，属于顶尖的专业之一。建议有意报考该专业的学生优先考虑南京农业大学，以获得最高水平的教育和科研资源。