东莞理工学院设有20个学院，提供62个本科专业。专业领域涵盖工学、管理学、文学、理学、经济学、法学和教育学等。具体专业包括通信工程、社会工作、软件工程、电子信息工程、机械设计制造及其自动化、计算机科学与技术、应用化学、环境工程、工商管理、能源与动力工程、国际经济与贸易、工业工程、自动化、会计学等。此外，有14个专业入选国家级一流专业建设点，14个专业入选广东省一流专业建设点。

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