专科制药工程专业主要学习的课程包括：

基础化学：

有机化学、物理化学和生物化学等。

化工原理：

化学反应工程、分离工程、传质传热等基本原理。

制药工程：

制药生产的基本原理和工艺流程。

药物化学：

药物的设计、合成和结构优化。

药物合成反应：

药物合成的各种化学反应。

药理学：

药物的作用机制、药效学和药代动力学。

药剂学：

药物的制剂制备、质量控制及稳定性。

天然药物化学：

天然来源药物的化学结构和性质。

应用光谱解析：

利用光谱技术进行药物分析。

制药工艺学：

药物生产过程中的工艺技术。

药用高分子材料：

用于制药的高分子材料的性质和应用。

制药分离工程：

药物生产中的分离技术。

药物分析：

药物的质量控制和分析方法。

制药装备与车间设计：

制药设备的选型、车间布局和设计。

药事管理学：

药品生产、流通和使用过程中的法规和管理。

药品营销：

药品的市场推广和销售策略。

此外，根据不同的专业方向（如中药制药、农药制药等），可能还会包括以下课程：

药用植物学

中药学

方剂学

中药化学

中药药剂学

中药制剂分析

中药药理学

植物学

农药学

这些课程旨在培养学生掌握制药工程的基本理论和技能，能够在药品生产、研发、质量控制、市场营销等领域胜任工作。