根据2023年QS世界大学排名，日本机械专业排名前三的院校如下：

东京大学

排名：

第23位

特点：东京大学的机械工程专业在国际上享有很高的声誉，其生产技术研究所非常有名，体现了强大的机械学科能力。工学系是东京大学最庞大的研究科之一，几乎覆盖了所有的工程学科，机械专业在环境、能源、纳米材料、生物、医疗、安全等领域都发挥着重要的作用。

京都大学

排名：

第36位

特点：京都大学的机械专业虽然较少，但非常精，主要注重微机学和流体力学的研究，就业率高。物理工学科中会有相关专业——机械系统科目，课程涵盖了物理工程相关领域的基础课程以及通识教育、基础工程教育等相关课程。

东京工业大学

排名：

第55位

特点：东京工业大学专攻工程技术与自然科学，是日本理工科大学之最，同时也是世界一流的理工科大学之一。机械专业非常强，涵盖了工程力学、材料力学、热力学等多个必修科目。

这些院校在机械专业领域都有显著的学术声誉和强大的科研实力，是学生选择机械专业时的优选。