以下是根据最新信息整理的日本本科医科专业排名：

东京大学

综合指数： 91.8

特色： 医学部脑科世界闻名，课程基于临床医学，训练临床医生。设有分子细胞生物学、机能生物学、病因·病理学、生体物理医学、脑神经医学等4年制博士课程及医科学修士课程。年度偏差值约75.0，国家医师考试合格率91%。

京都大学

综合指数： 90.4

特色： iPS细胞发祥地，培养多位诺贝尔奖获得者。专业涵盖医学医科学、社会健康医学系、人类健康科学系、基因医学四大专攻。

大阪大学

最新世界排名： 55名

特色： 作为日本7所帝国大学之一，大阪大学医学部的质量非常高。

庆应义塾大学

特色： 作为私立大学中的顶尖名校，庆应义塾大学医学部的医学专业非常优秀，但学费较昂贵。

东京医科牙科大学

特色： 以口腔医学和牙科医学专业闻名。

九州大学

特色： 在临床医学、康复医学、肿瘤医学和再生医学等领域享有很高的声誉。

名古屋大学

特色： 综合实力强，教学质量高。

东北大学

特色： 在临床医学、康复医学、肿瘤医学和再生医学等领域享有很高的声誉。

北海道大学

特色： 在临床医学、康复医学、肿瘤医学和再生医学等领域享有很高的声誉。

广岛大学

特色： 在临床医学、康复医学、肿瘤医学和再生医学等领域享有很高的声誉。

这些排名基于不同的评价标准和时间点，但总体来看，这些大学在日本乃至国际上都享有很高的声誉，特别是在临床医疗、康复医学、肿瘤医学和再生医学等领域。建议申请者根据自身兴趣和职业规划，选择合适的大学和专业。