截至2024年，全国系统工程专业排名如下：

清华大学- A+

哈尔滨工业大学- A+

浙江大学- A+

北京航空航天大学- A

北京理工大学- A

东北大学- A

上海交通大学- A

国防科技大学- A

哈尔滨工程大学- A-

东南大学- A-

建议：清华大学、哈尔滨工业大学和浙江大学在系统工程专业中均被评为A+，是考生们非常青睐的选择。