高淳区内的大学城是 南京高等职业教育创新创业园，也被称为南京第五座大学城。该大学城规划面积约为30平方公里，并规划了多所高校入驻。其中，南京机电职业技术学院高淳校区已经开始招生，但根据规划图，该校目前仅建成了一小部分设施。不远处的南京财经大学红山学院高淳校区正在建设中，目前处于一期工程的中后期，主体建筑基本完工。

高淳大学城目前有 5所大学，分别是：

1. 南京理工大学紫金学院

2. 南京机电职业技术学院

3. 南京财经大学红山学院

4. 江苏卫生健康职业学院

5. 苏州科技大学天平学院

此外，还有规划中的大学：

1. 南京工业大学高淳校区

2. 南京医科大学高淳校区

3. 南京航空航天大学金城学院高淳新校区

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