安徽工程大学最好的专业排名如下：

机械设计制造及其自动化

计算机科学与技术

材料成型及控制工程

软件工程

纺织工程

环境工程

应用化学

艺术设计

英语

行政管理

测控技术与仪器

轻化工程

电气工程

应用经济学

美术学

土木工程

体育学

外国语言文学

公共管理

数学

食品科学与工程

马克思主义理论

设计学

生物工程

管理科学与工程

化学

机械工程

控制科学与工程

这些排名综合了不同来源的数据，包括教育部学科评估、一流本科专业建设点名单、以及各专业的热度和推荐理由。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各专业的就业前景。