山东农业大学食品科学与工程学院的考研专业主要包括以下几个方向：

发酵工程

考试科目：

①101思想政治理论

②201英语一

③302数学二

④822微生物学（食品）

复试科目：代谢控制发酵

同等学力考生加试科目：生物工艺学

食品科学

考试科目：

①101思想政治理论

②201英语一

③302数学二

④821食品化学

复试科目：食品工艺学（含园产、畜产、粮油、冷藏）

同等学力考生加试科目：食品微生物、食品卫生学

食品加工与安全

考试科目：

①101思想政治理论

②201英语一

③302数学二

④876食品工艺学

食品工程 （086003）：

考试科目

①101思想政治理论

②201英语一

③302数学二

④821食品化学

生物工程与设备方向

考试科目：

①101思想政治理论

②201英语一

③302数学二

④822微生物学（食品）

复试科目：代谢控制发酵

同等学力考生加试科目：生物工艺学

农产品加工及贮藏工程

考试科目：

①101思想政治理论

②201英语一

③315化学（农）

④825食品化学与营养

复试科目：食品工艺学（含园产、畜产、粮油、冷藏）

同等学力考生加试科目：食品微生物、食品卫生学

建议

选择考研专业时，建议综合考虑个人的兴趣、职业规划以及未来的发展方向。如果对食品科学和工程领域有浓厚兴趣，可以考虑发酵工程、食品科学或食品加工与安全等方向。此外，生物工程与设备和农产品加工及贮藏工程也是不错的选择，具体选择哪个方向可以根据个人实际情况和目标进行权衡。

最后，建议登录山东农业大学的官方网站或研究生招生信息网，获取最新的考试科目、招生政策等信息，以确保选择最适合自己的专业。