复旦大学和上海交通大学都是中国顶尖的高等教育机构，在多个学科领域具有强大的实力。以下是它们在专业排名方面的对比：

顶尖学科数量

复旦大学：在多个排名中，复旦大学通常有14到27个中国顶尖学科。

上海交通大学：在多个排名中，上海交通大学通常有12到23个中国顶尖学科。

上海市最好学科数量

复旦大学：在上海市拥有38个最好学科。

上海交通大学：在上海市拥有59个最好学科。

优势学科

复旦大学：优势学科包括金融、计算机科学、医学等。经济学专业达到世界一流水平，与清华大学、南开大学、武汉大学一起进入前5。

上海交通大学：优势学科包括工科和医科，特别是机械工程、交通运输工程、电子信息科学与技术等。临床医学专业在软科中国发布的2022年中国最好学科排名前50%中位列第1。

综合排名信息

在2024年上海高校最佳学科排名中，复旦大学位列第一，上海交通大学排名第二。

部分学科排名

复旦大学：法学全国第一，社会学、政治学、计算机科学与技术、新闻传播学、金融学、数学、医学等学科均在全国前10名。

上海交通大学：机械工程、交通运输工程、电子信息科学与技术、临床医学、管理学等学科均在全国前10名。

结论：

复旦大学和上海交通大学在专业排名上各有千秋，复旦大学在人文社科领域有优势，而上海交通大学在理工科领域更为突出。两所学校在多个学科领域都有卓越的表现，是中国高等教育的重要支柱。