重庆交通大学在理科学科方面的专业排名如下：

电气工程及其自动化：

全国排名第四。

电子信息类 （包括电子信息工程、通信工程）：未具体列出排名，但属于热门专业。

计算机类（包括计算机科学与技术、物联网工程）：全国排名第五。

港口航道与海岸工程：

全国排名第五。

交通工程：

全国排名第六。

工程管理：

全国排名第七。

交通运输：

全国排名第十一。

土木工程：

全国排名第二十一。

船舶电子电气工程：

全国排名第四。

建议：

电气工程及其自动化和 计算机类专业在全国有较高的排名和声誉，适合对电子技术和计算机科学有浓厚兴趣的学生。

港口航道与海岸工程和 交通工程也是全国顶尖的专业，适合希望在交通基础设施领域发展的学生。

船舶电子电气工程是一个特色专业，全国排名第四，适合对船舶电子和电气工程有特定兴趣的学生。

这些排名基于最新的数据和统计信息，但具体排名可能会随时间和评价标准的变化而有所调整。建议考生在选择专业时，综合考虑自己的兴趣、职业规划以及学校的教学资源和就业情况。