截至2024年，北部湾大学共设置有 56个本科专业，分布在工、理、管、经文、法、艺等7个学科门类。学校面向全国30个省招生，按照8个大类和44个专业进行招生，8个大类涵盖28个专业，占全校78个专业的35.9%。这些专业中，有船舶与海洋工程、海洋科学等2个硕士学位授权一级学科，以及国际商务、机械、农业（渔业发展）、材料与化工、教育、体育、汉语国际教育、设计、音乐、资源与环境等10个硕士专业学位授权点。