肥城高考军校的专业主要分为以下几类：

指挥类专业

主要为各军兵种培养军事指挥管理人才，包括排长、连长、指导员、参谋等职位。毕业后，学员通常会被分配到各战区、军种部队的基层单位。

非指挥类专业

主要培养专业技术人才，如军医、军械、通信等。毕业后学员通常会被分配到科研单位、军事院校或技术保障部门。

合训分流专业

旨在培养既懂技术又会管理，还能指挥的复合型初级指挥军官。具体的专业设置可能包括测控技术与仪器、计算机科学与技术、通信工程、指挥自动化工程、自动化、外国语言文学、公共事业管理、管理工程、武器系统与发射工程、信息工程、舰船动力工程、核动力工程、电子工程、护理学、机械工程及其自动化、电气工程及其自动化、应用物理学、系统工程、装备经济管理等。

建议考生在报考军校时，根据自己的兴趣和职业规划，选择合适的专业。