高考日语的劣势主要包括以下几个方面：

学习时间较短，心理压力大：

相比英语从小到大的教育陪伴，日语学习只有1-3年的时间，从零开始学习会面临更大的心理压力，压力对部分学生的会产生影响，但因人而异，还需同学们根据自身情况实际考虑。

学习资源相对有限：

与英语相比，高中阶段日语学习的配套资源还是不够丰富。合适的练习题、模拟试卷等可能数量较少，质量也参差不齐。教材方面，除了通用的一些课本外，拓展性的、贴合高考且难度适中的教材不多。

师资水平参差不齐：

很多高中本身缺乏专业的日语教师，需要外聘或者与校外机构合作开展日语教学。市场上的日语教师水平差异较大，有些老师可能教学经验不足，无法精准地把握高考日语的重点、难点以及命题方向。

专业选择限制：

尽管大部分专业不限制日语考生，但部分如军事、国防等专业对日语考生有限制。学生在选择大学和专业时，需要仔细查阅招生简章，了解是否有语言限制。

学习成本较高：

日语高考的学习成本相对较高，包括培训费用和教材费用等。

语法和发音复杂：

日语的语法和发音相对复杂，学习起来需要付出更多的时间和精力。特别是在初级阶段，需要不断练习发音和记忆单词。

可能影响其他学科：

由于需要投入大量的时间和精力来学习日语，学生有时难以兼顾其他学科的学习，导致其他学科的成绩受到一定的影响。

资源少且质量参差不齐：

在一些地区，找到合适的日语教材和辅导资料可能较为困难，这可能影响学习进度和效果。

大学专业受限：

部分高校的某些专业在招生时会限制外语语种，只招收英语考生，尤其是一些涉及到对外交流、中外合作办学的专业，或者是对英语能力要求较高的理工科专业等。

学习人数较少：

高考日语考生占到了高考外语的3成，这意味着今后日语的学习人数会逐渐增加，而当前的人数则是属于小部分。

阅读理解难度较大：

日语的阅读理解难度主要源于两个方面：一是日语的表达方式比较特别，常常用中文一个词表达出日语中需要使用几个词才能表达出来的意思；二是日语句子的结构相对较为复杂，往往一个句子里面有好几个分句，而且日语分句之间往往没有明显的连词，对于零基础的学员来说有一定的难度。

小语种基础薄弱：

小语种日语高考资源一定没有英语多，可参考的资料也相对较少。还有一定的不确定性，小语种的高考成绩和英语是一样的，不存在一定的优惠政策，所以有可能出现英语试卷简单，但日语试卷难的的情况，这样就对日语同学就非常不利了，占不了优势。

这些劣势需要学生在选择高考日语时认真考虑，并根据自身情况做出合理的选择。