新高考模式存在以下缺点：

教师资源不均衡

学生自主选择权扩大，导致大部分学生按学科难易程度而非兴趣爱好选科，造成各科教师资源不均，资源浪费严重，影响基础自然科学的发展。

文理科难度不同，导致选择历史和地理的学生人数剧增，选择物理和化学的学生人数骤减，影响学校学科教师资源分配。

学生选课功利性

学生选课时存在困惑，大多没有考虑自己的兴趣，而是按照科目难易度选课，失去考试改革制度的本意，造成学生的功利性，纵容了策略化及功利化的偏科学习，影响全面发展。

走班制效果不理想

实行“走班制”增加了老师的学生管理困难，易于使学生养成松懈习惯，削弱老师的课堂职责。

学生压力增加

新高考实行选科制度，学生需要兼顾多个科目的学习，增加了学生的压力。

专业选择受影响

不同专业对考试科目的要求不同，学生需要根据自己的兴趣和特长选择考试科目，但同时也影响了学生的专业选择。

教师负担增加

教师需要根据学生的选择进行教学，但同时也增加了教师的负担，需要兼顾多个科目的教学。

志愿数量增加

院校+专业组的模式虽然减少了滑档风险，但相对来说加大了填报志愿的难度，尤其是对于没有填报经验的家长和学生来说，是一种考验。

数学考试难度下降

数学取消文理科后，难度下降，再加上物理、化学成为选考科目，对男生不利，可能影响自然科学的发展。

学生课业负担更重

学生疲于应付众多学科的合格考、等级考，负担更重，影响学习效果和能力培养。

赋分制度漏洞

等级赋分制下，等级考科目成绩与选考人数关联度较高，可能导致不公平现象。

报考难度增加

新高考需要填写45个院校专业组，每个专业组最多可填写12个专业，45个院校专业组之间要有明显梯度，排序要科学合理，否则有滑档风险。

调剂可能性大

由于报考难度增加，调剂可能性大，很难保证被自己喜欢的专业录取。

这些缺点反映了新高考模式在实施过程中面临的一些挑战和问题，需要在后续的改革中不断调整和优化。