吉安最好的大学是 井冈山大学，它不仅是吉安唯一一所综合性大学，还是江西省人民政府和教育部共同重点支持建设的高校，并且是科技部与江西省人民政府会商支持建设的高校，以及同济大学对口支援高校。井冈山大学还是硕士学位授予单位，并且拥有红色经典艺术教育示范基地和教育部全国高校思想政治理论课教师社会实践研修基地。

因此，从专业数量和学校的综合实力来看，井冈山大学在吉安市是最好的选择。