药化专业考研的推荐学校如下：

北京协和医学院：

在药物化学领域具有极高的声誉，考研难度很大，但实力非常强。

中国药科大学：

同样在药物化学领域处于领先地位，考研科目包括有机、分析、生化和生理解剖，难度也较高。

北京大学：

作为国内顶尖高校，其药物化学专业实力雄厚，考研竞争激烈。

沈阳药科大学：

在药物化学方面也有很好的表现，考研难度适中。

浙江大学：

实力较强，考研难度也较大。

复旦大学：

排名靠前，考研科目包括药化、药剂、药分、药理和药管，难度较高。

山东大学 、 中山大学、 四川大学等高校也在药物化学方面表现出色，但考研难度相对较大。

上海交通大学：

在药物化学领域也有很高的声誉，考研难度较大。

南京大学：

在药物化学方面表现较好，考研难度适中。

哈尔滨医科大学：

在药物化学领域也有一定的实力，考研难度适中。

建议

选择药化专业考研的学校时，建议综合考虑学校的声誉、专业实力、考研难度以及个人兴趣和发展方向。如果目标是顶尖高校，如北京协和医学院、中国药科大学或北京大学，需要做好充分的准备和竞争。如果希望选择一个考研难度相对较低的学校，可以考虑沈阳药科大学、浙江大学或复旦大学等。此外，还可以考虑一些在药物化学领域有特色的研究所，如中科院上药所或上海医工院。