在重大（重庆大学）和工商大学两所学校的会计专业中， 重庆大学的会计专业相对更好一些。以下是具体的原因：

历史底蕴：

重庆大学会计系创办历史悠久，早在1937年重庆大学商学院成立之初便作为商学院创院三个系之一，具有深厚的学术积淀。

学科实力：

重庆大学的会计专业是重庆市2018年首批本科一流专业立项建设项目，也是重庆市优势特色专业，2019年获批全国首批本科一流专业建设项目。该专业已经拥有会计学博士学位、硕士学位、会计专业硕士学位（MPAcc）授予权，成为在西南地区有优势，在全国有影响的学科。

师资队伍：

重庆大学会计系拥有25位在岗教师，其中9位教授、10位副教授、4位弘深青年教师、2位讲师，基本都获得博士学位，师资力量雄厚。

研究方向：

会计学科的主要研究方向包括会计与资本市场、会计理论与会计准则、公司财务与公司治理、审计和税务，研究领域广泛且深入。

综上所述，重庆大学的会计专业在学术实力、学科建设和师资队伍等方面都具有较强的优势，因此可以认为重大（重庆大学）的会计专业相对更好一些。