四川理工学院的优势专业包括：

化学工程与工艺：

该专业是四川理工学院的王牌专业之一，具有很高的声誉，涵盖了化学工艺、应用化学、工业催化等多个方向，培养了大量从事化工生产、技术研发和管理工作的高级人才。

过程装备与控制工程：

同样作为国家级特色专业，这个专业在化工、石油、天然气等行业有广泛的就业渠道，毕业生在工业生产第一线从事机械制造领域内的设计制造、科技开发、应用研究、运行管理和经营销售等方面工作。

生物工程：

特别是酿酒工程方向，该专业在业内具有一定的影响力，主要涉及酿造发酵技术。

自动化：

自动化专业在工业制造、能源、交通等多个领域都有应用，就业形势良好。

电气工程及其自动化：

这个专业在工科中就业情况较好。

机械制造及其自动化：

该专业注重实践能力和创新思维的培养，毕业生在机械制造、汽车工程等领域有广泛的就业机会。

材料科学与工程 （防腐蚀工程）：该专业在材料科学领域具有较高的声誉，注重理论与实践相结合，培养材料制备和加工技术的专业人才。

环境科学与工程：

随着环境保护意识的提高，该专业也成为了热门专业，旨在培养环境监测、污染控制和生态修复等方面的人才。

食品科学与工程：

该专业结合地方特色和市场需求，注重食品加工、质量控制和食品安全等方面的教育，毕业生能够在食品生产和监管等行业找到合适的工作岗位。

建筑工程学院：

设有土木工程、给水排水工程、工程管理、工程造价、工业工程等多个本科专业，以及建筑工程技术、工程造价2个专科专业。

根据以上信息，四川理工学院最好的专业可以认为是 化学工程与工艺，其次是 过程装备与控制工程和 生物工程，此外 自动化、 电气工程及其自动化、 机械制造及其自动化、 材料科学与工程、 环境科学与工程和 食品科学与工程等专业也备受推荐。

建议您根据个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。如果对化工、生物工程、自动化等领域感兴趣，四川理工学院都是很好的选择。