南京高考专项计划包括以下学校：

1. 南京大学

2. 东南大学

3. 南京农业大学

4. 中国矿业大学

5. 河海大学

6. 江南大学

7. 中国药科大学

8. 南京航空航天大学

9. 南京理工大学

10. 苏州大学

11. 南京师范大学

12. 南京工业大学

13. 江苏大学

14. 南京邮电大学

15. 江苏师范大学

16. 扬州大学

建议关注江苏省教育考试院或各高校官方网站获取最新信息，因为具体学校名单可能因年份和计划有所调整。