高考退档后， 电子档案会退回到省招生考试院。具体流程如下：

退档操作：

当考生被退档后，其电子档案会在电脑上完成退档操作，无需人工运送。

退档去向：

退档后的电子档案会先退回省招生考试院，然后再由各县一级招办接收。

纸质档案：

如果考生被退档，其纸质档案通常仍保存在原高中学校，一般会在学校开学时邮寄给考生所在大学，或者由学生自行携带前往大学。

因此，如果考生被退档，其电子档案最终会退回到省招生考试院，而纸质档案则会根据学校安排进行后续处理。建议考生及时与所在高中学校或省招生考试院联系，了解具体的档案处理流程和时间表。