2016年自动化专业排名如下：

清华大学

东北大学

哈尔滨工业大学

北京航空航天大学

上海交通大学

浙江大学

华中科技大学

西安交通大学

北京理工大学

国防科学技术大学

东南大学

南京理工大学

中南大学

建议：

清华大学、 东北大学和 哈尔滨工业大学在自动化专业方面具有很高的声誉和实力，建议优先考虑。

北京航空航天大学、 上海交通大学和 浙江大学也是自动化专业较强的学校，根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校。

华中科技大学、 西安交通大学和 北京理工大学等学校也有很好的自动化专业，可以作为备选。

国防科学技术大学在国防领域的自动化专业具有独特优势，适合对国防技术感兴趣的学生。

东南大学和 南京理工大学等学校也有不错的自动化专业，可以根据具体专业方向和就业情况进一步了解。

希望这些信息对你有所帮助。