高考小科的命题工作主要 由各省（直辖市、自治区）的教育考试院组织。具体到某一科目，如果是全国统一命题的科目，则由教育部考试中心统一命题；如果是地方自主命题的科目，则由各省自行命题。

具体来说：

全国统一命题科目：

如语文、数学、外语等，由教育部考试中心统一命题。

地方自主命题科目：

如物理、历史、化学、政治、生物、地理等，由各省自行命题。

因此，对于新高考小科的具体命题机构，需要根据科目是否属于全国统一命题来判断。如果是全国统一命题的科目，则由教育部考试中心命题；如果是地方自主命题的科目，则由各省的教育考试院命题。