选择上海军官大学的专业时，可以从以下几个方面进行考虑：

个人兴趣和职业规划

指挥类专业：适合希望成为部队行政干部或带兵军官的学生。例如，武器系统与工程、电气工程、炮兵指挥、雷达工程指挥、弹药工程与爆炸技术指挥、网点智慧与工程、指挥信息系统工程等。

技术类专业：适合希望成为技术型军官的学生。例如，电子信息工程、通信工程、航天工程、信息工程、电子工程、系统科学与工程等。

专业热门程度和就业前景

热门专业：如通信工程、系统科学与工程、军事心理学、军械管理工程、军事采购专业等，这些专业不仅热门，而且就业前景较好，能够在全军各军兵种技术、科研、保障维修等岗位任职。

边防指挥专业：就业率高，毕业生可以在边防部队、人民警察和武警部队等多个岗位任职。

军队分配原则

军种和专业优先级：军队分配原则是按照军种来分的，因此选择专业时可以考虑自己的兴趣是否与某个军种更匹配。例如，如果希望加入空军，那么选择与空军相关的专业可能更有优势。

个人分数和录取情况

分数参考：选择专业时，还需要结合自己的分数和本省当年的招生专业目录、院校招生简章、录取分数分布统计等信息进行参考，选择有把握录取的专业。

性别和专业限制

女生专业：女生可以报考军校的语言专业或财务管理专业，如解放军外国语学院和军事经济学院。

建议

明确目标：首先明确自己的兴趣和职业规划，是希望成为行政干部还是技术型军官。

了解专业：详细了解各个专业的特点、就业前景和发展潜力。

参考分数：结合自己的分数和录取情况，选择有把握录取的专业。

考虑军种：考虑自己的兴趣是否与某个军种更匹配，选择相应的专业。

通过以上因素的综合考虑，选择最适合自己的专业将有助于在军校中取得更好的发展。