在长春中医药大学，以下专业被认为是最好的专业：

中医学

中药学

针灸推拿学

中医骨科伤科学

中西医临床医学

中药资源与开发

护理学

制药工程

临床医学

药学

药物制剂

康复治疗学

公共事业管理

这些专业在国家级和省级一流本科专业建设点中均有入选，且被学校视为王牌专业。特别是中医学和中药学，作为学校的王牌专业，具有很高的声誉和地位。

建议考生在选择专业时，可以优先考虑这些王牌专业，因为它们不仅在学术和教学质量上有较高水平，而且在行业内也有较好的就业前景。